O Rio Atibaia é responsável por 95% do fornecimento de água para o município, enquanto o rio Capivari fornece 5%.
A qualidade da água desses mananciais é insatisfatória, sendo necessárias adoções de medidas preventivas e de controle permanente de qualidade em cada fase do processo de produção, armazenamento e distribuição.
A vazão média do Rio Atibaia na seção de captação é de 12 m³/s e a vazão mínima de 10 m³/s, enquanto o Rio Capivari tem vazão média na ordem de 1,2 m³/s e com vazão mínima de 0,80 m³/s.
O Rio Atibaia faz parte da Bacia Hidrográfica dos rios Piracicaba, Capivari e Jundiaí, a qual também é formadora dos reservatórios do Sistema Cantareira.
O Sistema Cantareira é formado por quatro reservatórios, sendo três localizados na bacia do Piracicaba, Capivari e Jundiaí - Atibainha, Cachoeira e Jaguari-Jacareí, e um pertencente à bacia do Alto Tietê - reservatório Paiva Castro ou Junquerí.
As captações de recalque de água bruta são compostas basicamente das seguintes unidades a montante das ETAs: